La intención del CERpIE es ofrecer una investigación aplicada y profesional hacia las empresas y las instituciones, poniendo a su disposición una masa crítica de personal multidisciplinar con la vocación de convertirse en colaboradores externos de confianza para los organismos. Así pues, con especial referencia a los objetivos de investigación, transferencia de tecnología y formación permanente que son los ámbitos básicos de actuación del CERpIE, éstos se centran en las siguientes líneas de trabajo:

1. Línea de gestión de la edificación.
2. Línea de prevención de riesgos laborales, ergonomía y medio ambiente.
3. Línea de innovación en las empresas y organizaciones.